omicR It creates fasta files, downloads genomes from NCBI using the refseq number, creates databases to run BLAST+, runs BLAST+ and filters these results to obtain the best match per sequence. These ...
NGS解析や遺伝子解析を行う際、FASTAファイルを染色体ごとに分割したい場面が多々あります。そこで、Pythonを使って簡単に染色体ごとにFASTAファイルを分割し、元のディレクトリに出力するスクリプトを作成しました。 このスクリプトは、染色体（または ...
This will install the module fasta containing reader and writer functions, as well as a serie of scripts in /usr/local/bin/. USAGE fasta_2nuc.py [OPTION] [FILE...] DESCRIPTION Format a FASTA file into ...
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