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birc-gsa/fasta-python

Genome sequences are usually stored in so-called FASTA files, and we will use the same in this class. However, we will not need to full specification of this file format, since genomic data is ...
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Python-program-to-calculate-N50-from-the-FASTA-format-contigs-file.

Python Program to Calculate N50 from the FASTA Format Contigs File This program uses the BioPython library to read a FASTA format file and extract details such as the number of contigs, total contig ...
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FASTAファイルを染色体ごとに分割するPythonスクリプト：split_fasta.py

NGS解析や遺伝子解析を行う際、FASTAファイルを染色体ごとに分割したい場面が多々あります。そこで、Pythonを使って簡単に染色体ごとにFASTAファイルを分割し、元のディレクトリに出力するスクリプトを作成しました。 このスクリプトは、染色体（または ...
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fastaファイルに含まれる配列をアライメントして、距離行列を得る ...

この記事はすこし専門的な内容になっており、『生物学に特化した短編小説とエッセイ』とは別のマガジンに組み込まれています。 遺伝学とプログラミングに興味がある方はぜひ試してみてください。 ・fastaファイルに含まれる配列をアライメントして ...