condaで一撃で入った。 2. GeneMiner チュートリアル通りに入れた。 エラーが出たけど、ファイルの中身の名前を修正して、 python setup.py installとしたら問題なく動いてくれた。 FishTEDBならSpeciesから適当な種のトランスポゾンとかfasta形式のファイルを取得する。

塩基配列中に改行が入ったFASTAファイルを2行単位のFASTAファイルに変換するシェルスクリプトです。Linux環境で動きます。 アセンブルしたデータやオンラインデータベースからダウンロードしたFASTAファイルは、配列中に改行が入っていることがしばしばです。

Identity: 96.62% ⭐⭐⭐ (Nearly identical) Score: 31,410.0 (Optimal) Matches: 16,055 bp (96.62%) Mismatches: 422 bp (2.54%) Gaps: 139 bp (0.84%) Biological Interpretation: → Both species are NEARLY ...