生物情報の解析をしていると、NCBIで検索した遺伝子群の配列(mRNAやタンパク質)を一括で取得したいと思う場面がよくあります。 特に、「Send to → File」機能で得られる gene_result.txt のようなタブ区切りファイルから、自動的に配列を収集できたら便利です ...
遺伝子や転写物の情報を扱うために様々なファイル形式が使われています。その中でも特に重要なのがGFF(General Feature Format)とGTF(Gene Transfer Format)です。これらのファイル形式を効率的に処理するために開発されたのが「GffRead」というツールです。
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