FASTA to CSV: Converts a FASTA file into a CSV file containing accession IDs and sequences. CSV to FASTA: Converts a CSV file containing accession IDs and sequences back into FASTA format. -i or ...
塩基配列中に改行が入ったFASTAファイルを2行単位のFASTAファイルに変換するシェルスクリプトです。Linux環境で動きます。 アセンブルしたデータやオンラインデータベースからダウンロードしたFASTAファイルは、配列中に改行が入っていることがしばしばです。
Notifications You must be signed in to change notification settings Input: - VCF file containing variant call data. This can either be a multivcf or a single-sample vcf. Output: - Two files: - ...
生物情報の解析をしていると、NCBIで検索した遺伝子群の配列(mRNAやタンパク質)を一括で取得したいと思う場面がよくあります。 特に、「Send to → File」機能で得られる gene_result.txt のようなタブ区切りファイルから、自動的に配列を収集できたら便利です ...