Pairwise alignment class: Using the Needleman-Wunsch and Smith-Waterman algorithms, this project uses two classes to align two sequences of the same biotype (protein, R/DNA): a Substitution Matrix ...
次世代シーケンシング (NGS) データの解析において、リードのアライメントは不可欠なステップです。本記事では、bwa と bwa-mem2 を用いた自動アラインメントパイプラインを構築する Python スクリプトをご紹介します。このスクリプトは、NGS データ解析を効率 ...